2001年，EA正式宣布将在当年秋天发布《命令与征服：红色警戒2》的新资料片《红色警戒2：尤里的复仇》。因《红色警戒2：尤里的复仇》盒装艺术上的图像易让人联想到对世贸中心的袭击，EA公司决定重新包装游戏。2001年6月19日，EA工作室宣布《红色警戒2：尤里的复仇》推迟到10月9日发布，未说明具体原因。2001年10月9日，该游戏正式发行。 游戏承接《红色警戒2》剧情，讲述尤里逃脱盟国抓捕后，启动大战期间悄悄搭建在全球各地的心灵控制器，妄图控制全人类心灵。此时盟军和苏联反抗已来不及，唯一办法是利用时间机器回到大战初期改写历史。战役仍分盟军篇和苏联篇。若玩家扮演盟军指挥官，最终能在南极活捉尤里，并将其终身囚禁在心灵隔离室；若扮演苏联指挥官，苏军会抢夺时间机器回到过去，挫败尤里阴谋，逆转苏联战败命运，最终征服地球并开始向外太空发展。 尤里是苏联科学家、心理学家和军事顾问，从小具备心灵控制能力，能在战场上控制大部分心灵脆弱的敌军部队。他受苏联总理罗曼诺夫重用后仕途顺遂，却在战争中背叛苏联，趁乱建立尤里国。谭雅擅长双枪狙杀目标、爆破、自由泳，掌握15种徒手杀人手法，身手矫健且不受尤里影响。索菲亚是苏联中尉，她协同指挥官操纵时间机器回到过去，在盟军入侵莫斯科前打败盟军，挫败尤里阴谋。最后战役中，尤里侥幸逃脱，企图操纵时间机器回到过去重写历史，索菲亚机智地在时间机器上动手脚，让尤里被传送到侏罗纪成了霸王龙的食物。 在《红色警戒》世界观里，爱因斯坦发明时间机器，用它回到过去刺杀希特勒，避免了二战爆发。其后续研究帮助盟国创造出幻影坦克、光棱坦克、光棱塔等尖端科技装备，确立了盟军在科技上的优势。游戏沿用原版所有单位，并根据阵营不同微调属性。游戏中兵种是主要单位，分为3个级别，级别越高战斗能力越强，各阵营一般都有常见兵种。