“新世纪教育改革法”（通称“BR”）规定，从日本全国中学三年生里选出最不良的一个班级，让所有成员自相残杀，直至仅一人存活。七原秋也与中川典子从BR中脱身、离开孤岛两年后，人类世界进入恐怖主义时代。首都被反BR国家的“恐怖分子”炸成废墟，政府判定七原是凶犯并对其进行国际通缉。首都崩坏一年后，七原作为反BR法组织“wild seven”的领袖，向所有成人宣战。成人们为了剿杀七原，以反恐之名策划了新游戏——“新世纪反恐对策特别法”，通称BRⅡ。 某天，汇集了各地不良少年和逃课问题生的鹿之砦中学校3年B组42名学生，在圣诞节休学旅行去滑雪学校的路上，被军队绑架到一座孤岛。他们被要求换上军服，集合到巨大军营时，指导教师RIKI出现，向陷入混乱的学生公布绑架理由，说明了BRⅡ的游戏规则：一是歼灭潜伏在孤岛内的恐怖分子七原等人者获胜；二是限时三天；三是采取二人组合接力形式交替作战，且生死诛连。不允许学生有异议，他们被强制加入这场镇压恐怖分子的战斗。其中，有人因首都爆炸事件失去亲人，对七原有恨意和复仇决心，但也有人拒绝合作，被当场射杀，其同一出席番号的组员因生死诛连规则，颈上金属项圈自动爆破丧命。 剩下的40名学生按出席号码顺序，被迫乘6艘自动艇前往“战场”。他们奋力划动剧烈晃动的小艇，浑身被浪打湿，拼命向孤岛进发。然而即将登陆时，恐怖分子发动攻击，光弹交织，迫击炮在水面炸响。学生们惊愕之下只有躲闪之力，有人被打成筛子，有人被炮弹击飞。Wild Seven成员不知道进攻者是中学生，怀着对BR国家宣战的信念全力攻击。登上陆地的学生因弹药告罄想撤退，却仍遭炮火袭击，无处藏身。战斗到此时，只剩26名成员的学生们醒悟过来，他们已无路可退，只能端起武器，卷入成人策划的这场孩子们自相残杀的战争游戏。