武芸者オメガは常に宇宙最強の相手を求めて銀河を旅しており、今回は地球にやってきた。彼の目的は宇宙刑事シャイダーを倒すこと。オメガは全身が武器のような恐ろしい存在で、多くの宇宙刑事が彼の手にかかって命を落としている。 このオメガを見逃す訳がないフーマは、すぐに行動を起こし、オメガと手を組むことになった。パトロール中の大は黒マント姿のオメガに襲われ、オメガは大に一対一の真剣勝負を挑んできた。過去にギャバン、シャリバンに敗れたオメガは、シャイダーを倒すことに執念を燃やしている。 一方、フーマの行動隊長ヘスラーも、オメガより先にシャイダーを倒すため、ギャル軍団を率いて作戦行動に出る。宇宙刑事シャイダーは、前面にオメガ、背後にフーマ軍団という二つの強敵に挟まれ、戦わなければならない状況となった。シャイダーと銀河最強の男・オメガとの一騎打ちの時が近づいている。（C)東映