《船长康先生》围绕两个人展开故事：一人正活在梦想之中，另一人却因一场事故失去了梦想，这场事故从此彻底改变了两人的人生。康每日不分白天黑夜，和两位老渔民一同出海捕鱼，似乎只有渔网的重量能让他切实感受到自己活在世上。康的儿子钟杰年少时就展现出卓越的棒球天赋，如今却和父母住在一起，满心不情愿地帮父亲干活。钟杰梦想破灭后，觉得小港城的生活无比压抑；康则为儿子黯然伤神，认为一切都是自己的错。父子俩心中都背负着沉重的愧疚与责任感，从未将对彼此的尊敬与爱说出口。钟杰丢失梦想后，深感小港城的生活令人窒息，康也因自觉负有责任而替儿子痛心。强烈的内疚与责任感，让他们始终未把尊敬和亲情化为言语。随着冬天临近，雇船员愈发困难，钟杰只好跟着父亲出海。在海上的日子里，父子俩意识到，他们只能相互依靠。