经过一番艰苦激战，汽车人成功夺回饱经战火洗礼的母星赛博坦。擎天柱对大黄蜂等部下的卓越功勋予以表彰后，便和千斤顶一同踏上了前往宇宙深处探寻火种源的漫漫征程。与此同时，宇宙大帝唤醒了沉睡在海底的威震天（弗兰克·维尔克 配音），并对其力量进行升级，企图借此消灭普神，开启混沌纪元。拥有光速的威震天气势汹汹地朝着赛博坦逼近。而在赛博坦这边，大黄蜂等人一边开展星球的复建工作，一边防范红蜘蛛和震荡波等人的侵袭。然而，两只巨狰狞的突然出现让局势陷入混乱。似乎察觉到霸天虎的衰落，具有原始兽性的巨狰狞冲云霄蠢蠢欲动，四处为祸。在赛博坦黎明的前夕，和平仍遥遥无期，最可怕的远古军团即将复活……