水与绿色的行星雷扎里亚上，有从梅加罗斯星流亡而来的王族住所和地球的研究所。地球人埃里克等人在从地球向研究所运送物资的途中，发现了神秘遗迹，同时遭到了不明身份者的袭击。原来，那处遗迹是梅加罗斯的克劳德总督秘密挖掘的、能将星球本身转化为能量驱动的巨大飞船伊克西翁号。卷入策划梅加罗斯政变的克劳德阴谋中的地球研究员们、所长以及被制造出来的人造人安托瓦内特，他们的命运将会如何呢？