三国时期，战火纷飞。年轻的华佗在故乡亳州为百姓治病，日子过得自在逍遥。华佗凭借精湛医术让太守之女明心起死回生，赢得了神医的美名，也自此与明心结下了深厚的缘分。为了研制麻沸散给明心医治眼睛，华佗踏上了游历寻药之路。在都城，华佗多次与英雄关羽、奸雄曹操以及师兄吴思德相遇，深切体会到了官场的黑暗和世态的凉薄。最令华佗痛心疾首的是，心爱的姑娘明心竟被吴思德强行霸占。在东吴的山中，绝望的华佗得到隐者的点化，恍然大悟，决心成为一名医人、医心、医国的苍生大医。经历了赤壁之战、刮骨疗毒、秘境历险等种种事件，无论遭遇多少艰难险阻，华佗拯救苍生的赤子之心始终未曾动摇。麻沸散研制成功后，华佗和明心的爱情也终成眷属。然而，就在幸福降临之际，曹操因疾病、猜疑和怨恨将华佗抓走，这位行医济世、妙手回春的苍生大医最终在囚牢中离世。