神秘组织GOD觊觎神敬太郎博士的人类工学技术，胁迫他加入，教授果断拒绝，因而遭到袭击，他的儿子神敬介也不幸遇害。重伤的父亲一心想要让儿子复活，顾不上自身伤势，亲自操刀为儿子进行改造手术。敬介苏醒时，父亲已然离世。通过计算机留言，敬介得知GOD妄图危害世界的阴谋，于是肩负起对抗邪恶的重任，化身为第五号假面骑士——假面骑士X。