公元2199年，地球遭受神秘行星加米拉斯的攻击，陷入濒临灭亡的危机。游星炸弹释放的放射能污染了地球表面，人类被迫逃往地底生存。就连地球防卫军宇宙舰队这一人类的最终希望，也在冥王星战役中全军覆没。当人类陷入绝望之时，远在14万8千光年外的伊斯坎达尔星给地球带来了希望。配备“波动引擎”的大和号缓缓启动，即将开启一场来回29万6千光年的漫长旅途……