《深空九号》的构想诞生于1991年，就在吉恩·罗登伯里去世前不久。该剧的故事设定在太空站深空九号（前卡达西人采矿站“Terok Nor”）上，该太空站由星际联邦和贝久政府共同管理，而贝久星刚刚从卡达西人的殖民统治中获得解放。据作者之一的伯曼介绍，他和皮勒原本打算以一个殖民行星作为故事背景，但他们觉得太空站能吸引更多观众，还能节省用于外景和星球表面拍摄的资金。同时，他们不想让这部新剧的故事发生在星舰上，因为当时《下一代》仍在播出。用伯曼的话说，“同时有两部剧集——两组角色——都在探索未知领域，这看起来有点荒谬”。在《深空九号》的首集中，太空站从贝久星轨道移至附近新发现的贝久虫洞附近。这个虫洞通向遥远且未知的第三象限，不久后，深空九号便成为了新的星际贸易和探索中心。