大梁朝局看似安稳，然而边境却战火频仍。守护大梁北境的长林军战功卓著、威名远扬。在一次北境战事里，内阁首辅荀白水暗中切断前线补给，致使长林军副帅萧平章（黄晓明饰）重伤。正在琅琊阁学艺的弟弟萧平旌（刘昊然饰）得知消息后下山查案。三十年前，邻国夜秦爆发疫情，大梁为求自保封锁国道。濮阳缨（郭京飞饰）因灭国之仇潜伏在大梁，他勾结琅琊榜第一高手、东海国主墨淄侯，企图暗中瓦解梁帝势力和长林府。两人在京城各处投毒，疫情迅速扩散。濮阳缨设下圈套，让萧平旌和萧平章先后中毒。此时北境告急，萧平章放弃治疗奔赴前线，最终毒发身亡。一年后，梁帝驾崩，大渝进犯大梁。荀白水与莱阳王萧元启（吴昊宸饰）哄骗年幼的梁帝颁旨，禁止边境兴兵，萧平旌抗旨出征并击溃大渝，但长林编制也因此被废除。萧元启与墨淄侯暗中勾结，卖国谋逆。萧平旌在危急时刻……