荆爷爷在对抗山贼时不幸英勇牺牲，留下庆和樊于期（王亚楠 饰）这两位少年。此后，樊于期返回秦国，成为白起将军麾下的一员战将，而庆则留在了快活谷。他们心爱的女孩小沪（郑家榆 饰）在逃亡途中历经重重磨难，最终还被荆轲抛弃。荆轲因小沪的背叛而陷入绝望，随后加入了刺客组织“天灭”。樊于期虽在秦国立下了赫赫战功，但心中始终对一起长大的伙伴以及初恋小沪念念不忘。秦王把公主许配给樊于期，这一举动引发了丞相吕不韦的不满，从而导致宫廷斗争爆发。 荆轲成了盖聂的学生，成长为一名出色的刺客。然而在一次执行任务时，他不得不亲手杀死深爱的女孩采儿，这令他陷入了绝望之境。就在这时，他结识了一生的知己高渐离，还有圣女云兮。云兮的离世唤醒了荆轲，让他决定放弃刺客生涯，去寻找一个没有杀戮的世界。