因阿笠博士家浴室故障，江户川柯南（高山南 配音）和小兰（山崎和佳奈 配音）、灰原哀（林原惠美 配音）去大众浴池洗澡。柯南不慎滑倒撞头，被两名神秘陌生人带走。一番混乱后，天才诈欺师娜娜（深见梨加 配音）和神秘杀手近藤（香川照之 配音）把失去记忆的柯南带到一处隐蔽别墅，还伪装成他的父母，而追踪近藤他们的阿笠博士和灰原遭遇严重车祸。娜娜所在的犯罪团伙似乎企图制造一起炸弹恐怖袭击。与此同时，某杂志编辑水岛早苗（广末凉子 配音）怀疑丈夫近藤有外遇，委托毛利小五郎调查其行踪。随着时间推移，险恶阴谋逐渐浮出水面…… 本片是《名侦探柯南》漫画连载二十周年的特别企划，编剧由《盗钥匙的方法》的导演兼编剧内田贤治担任，香川照之、广末凉子为《盗》中自己的角色再度配音。