JFK高中是一所位于新泽西州纽瓦克落后街区的公立学校，在这里就读的是有特殊需求的学生，其中包括自闭症患者和身体残疾的孩子等。珍妮特·米诺（Janet Mino）已经和她班上的自闭症学生相处了四年。2012年，这些学生迎来了毕业时刻，他们将彻底告别公立学校系统为他们营造的有安全感的环境。纪录片《保存最好的秘密》记录了米诺女士和她的学生们在毕业前一年半时间里的经历。随着时间日益紧迫，这些年轻人必须在成人世界中找到自己的立足之地，比如一份能够胜任的工作，否则他们就会和许多自闭症患者一样，面临闲坐在家、被福利院收容或者流落街头的境地。