平凡的高中生深町晶偶然间捡到了一个奇妙的胶囊。被从胶囊里飞出来的怪异物体包裹着，晶落入了河中。与此同时，他的女朋友瀬川瑞紀遭到了怪物和神秘男子们的逼近。不过，从河里出现的另一名怪人击退了怪物——超獣化兵（ゾアノイド）。这些男子的真实身份是秘密结社クロノス的成员，而胶囊则是结社制造的能强化人类的“ユニットガイバー”。晶获得了用ユニットガイバー殖装（变身）为怪人＝ガイバーI的能力。他与クロノス的战斗就此展开……。剧中登场的另一位ガイバー，即ガイバーII与原作不同，变更为了女性角色。本作作为OVA发售的同日，还在部分地区进行了剧场公映。