《沉默》改编自日本著名作家远藤周作的同名小说。故事背景设定在德川幕府时代实施禁教令的长崎附近小村庄。一名葡萄牙耶稣会教士偷渡至日本传教，同时着手调查恩师因遭受“穴吊”酷刑而宣誓弃教这一事件。在当时欧洲人看来，此事不仅是个人的挫折，更是整个欧洲信仰与思想层面的耻辱和失败。在传教与寻访途中，他遭遇了信仰与反叛、圣洁与背德、强权与卑微、受难与恐惧、坚贞与隐忍、挣扎与超脱等种种两难处境，这迫使他对基督信仰展开更深入、更贴合现实的思考。最终，他仿佛重走了一遍恩师的心路，形成了自己对信仰的独特诠释与实践方式。