“炼金术”指的是通过不同组合来产生“金”的技术。人工孕育“生物”的尝试也是神秘研究之一，各种实验将在鲜为人知的现代舞台上展开故事。本故事的关键是融合了炼金术中最高技术的产物“人工生命体（怪物）Chemy”。作为被保存在名为“Ride Chemy Card”卡牌中的101个生命体，Chemy是模仿蚱蜢、蒸汽火车等世间万物制造出来的。 然而，这些本应被谨慎保管的Chemy突然从卡牌中出现，全部被释放了出来。偶然卷入这一事件的主人公是高中生一之濑宝太郎，他被托付了假面骑士Gotchard的变身腰带“Gotchar驱动器”，并肩负起回收散落在世间的Chemy的使命。