2022 年，日本频繁发生金鱼杀人事件。公安特设课超常事件想定班（マル超）的环栄李花与资深刑警山中伝蔵、东大毕业的年轻希望之星立花雪根组队展开调查。金鱼变成子弹、人体离奇消失、神代遗迹现身……栄李花等人不断接触各种“异常”现象，最终追寻到“尼安德特人的愤怒”这一关键词。作为这个故事序章的作品是《超级智人：开端》（SUPER SAPIENSS THE BEGINNING），它开启了持续百年的超级智人（SUPERSAPIENSS）项目的最初起点。