当邪恶的蛋头博士（Doctor Robotnik）出现在天空之地（Land of the Sky），向世界知名英雄刺猬索尼克（Sonic the Hedgehog）求助时，索尼克心存疑虑。他勉强接受了蛋头博士的任务，深入黑暗之地（Land of Darkness）。在那里，索尼克发现相信蛋头博士从来都不是个好主意。现在，索尼克和他的朋友——狐狸塔尔斯（Tails the Fox）和针鼹鼠纳克鲁斯（Knuckles the Echidna）必须面对……