第一季的黑死病可看作人类的隐喻，而第二季的黑死病则像是有组织的犯罪，是隐匿的威胁，包括盗贼团伙、黑社会以及城市阴暗面中的“石貂”政府。 上一场黑死病大规模爆发五年后，塞维利亚渐渐恢复往昔荣光。它依旧保持着对美洲的贸易垄断，日益繁荣，人口也增至历史最高点。然而，政府却无力为居民提供食物和最低限度的援助服务，社会不满情绪不断加剧，催生了“石貂”这个控制整座城市的黑社会组织。 在远离塞维利亚的新大陆火地岛，马特奥收到了特雷莎的来信。巴莱里奥面临“石貂”的死亡威胁，他请求马特奥回来相助，称自己生命危在旦夕。 塞维利亚迎来了新市长蓬泰科尔沃，其职责是维护城市秩序、制伏黑社会。为此，他将借助马特奥的才能以及卧底流氓巴埃萨的协助。 特蕾莎继续推进由瓦莱里奥发起的挽救失足妇女行动，不过现在面临着额外的危险，城市处于黑手党的控制之下……