新人秘密服务人员夏守美早妃在护卫御手洗博士期间，遭到世界暗杀集团“自我主义”（Egoisma）的女干部帕特拉袭击，陷入绝境。不过，她被身着强化战衣的假面女战士密涅瓦所救。密涅瓦隶属于为对抗“自我主义”而成立的组织“神秘综合秘密服务”（Mystic integral secret service），简称MISS。密涅瓦的真实身份是曾与美早妃同在一个秘密服务部门的备冬勇希。由于密涅瓦的身份必须保密，不知情的美早妃对已离职消失的勇希心怀轻蔑，还将密涅瓦视为竞争对手。后来，美早妃得知御手洗博士的女儿被绑架为人质，便独自前去营救。她成功从帕特拉手中夺回了人质，却又在面对“自我主义”怪人德古拉主义（Draculisma）的吸血攻击时陷入困境……