在这个各个角落都已被探索殆尽的世界里，唯有大洞穴“阿比斯”仍是一片秘境。它深不见底，不知向何方延伸，巨大的纵向洞穴中栖息着奇奇怪怪的生物，还沉睡着现今人类无法制造的珍贵遗物。“阿比斯”那充满神秘的模样吸引着人们，驱使他们踏上冒险之旅。那些多次挑战大洞穴的冒险者，逐渐获得了“探窟家”的称号。 居住在阿比斯边缘城镇“奥斯”的孤儿莉可，梦想着有朝一日能成为像母亲那样伟大的探窟家，解开阿比斯的谜团。某天，母亲莱萨的白笛被发现，这成为了契机，莉可决定潜入阿比斯深处。她捡到了丧失记忆的机器人雷格，雷格为了寻找自己的记忆，决定与莉可一同前行。 在深界四层，莉可中了穿弹兽的毒，“生骸”娜娜奇救了她。娜娜奇也加入了他们，三人的冒险朝着波多尔多所在的深界五层继续推进。在那里，他们遇见了一个自称普鲁修卡的女孩子……