某小村中学，对考古满怀浓厚兴趣的老师八部高史（竹中直人 饰）及其学生月岛令子（上野めぐみ 饰）在开展一项研究时突然失踪。此事一出，校内人心惶惶，各种流言猜测不断。行为怪异的考古学家稗田礼二郎（沢田研二 饰）受八部老师邀请来到这所学校，他偶然间救助了八部的儿子正雄（工藤正貴 饰）。正雄既忧心父亲的安危，又挂念自己暗恋的女孩令子。稗田运用自己发明的妖怪探测器，在夜晚和正雄来到学校。结果发现，八部老师在考察一座古墓时，不小心释放了藏在其中的妖怪比留子。据说比留子是《古事记》中初神伊耶那岐和伊耶那美的孩子。她的复活，给平静的学校带来了一场血雨腥风…… 本片根据诸星大二郎的漫画《妖怪ハンター》改编。