《被告人》的故事围绕一位强力检察官沦为死囚后设法洗脱罪名展开。主人公是大韩民国最佳强力检察官，他从未让一名被告人逃脱定罪。然而，一系列突发事件让他从检察官变成了被关押在监狱看守所的嫌犯。更糟糕的是，事件发生后他暂时丧失了全部记忆，这让他洗刷冤屈的难度大大增加。他陷入了人生最艰难的两难境地，不得不与检察官们展开一场殊死斗争。