鸣人（ナルト）与佐助（サスケ）在终结之谷展开了激斗，那场最终对决令人难忘。此后，第四次忍界大战落下帷幕。佐助为了弥补过去所犯下的罪行，未曾返回木叶隐村（木ノ葉隠れの里），独自踏上了漫长的赎罪之旅。 就在此时，木叶隐村突然发生忍者失踪事件，引起了六代目火影卡卡西（カカシ）和鸣人的警觉。紧接着，神秘忍者对村子发起了袭击。 在这场赎罪之旅的尽头，佐助将会看到怎样的未来呢？