某一天，假面骑士Ghost即天空寺尊（西铭骏）面前出现了假面骑士Dark Ghost（木村了）。Dark Ghost的目的是收集100位英雄的眼魂（图标），制作出究极眼魂，将所有人都变成Ghost。尊、深海诚（山本凉介）、阿兰（矶村勇斗）挺身而出，对抗Dark Ghost。