小学三年级的姬乃搬到了乡下的一座大宅院。然而，这里竟是忍者宅院！能操控火焰的赤卷、负责水相关事务的青卷、担当周日工匠工作的黄卷。忍者们误把姬乃当成公主，各自用拿手的本领巧妙地解决小问题。但忍者的能力不止如此。青卷和黄卷的分身合体混合后会诞生绿卷，同样，赤卷和青卷能变出紫卷，赤卷和黄卷会产生橙卷！在与这些色彩斑斓的忍者开启奇妙生活的同时，巨大的龙卷风正朝着宅院逼近。姬乃一家会遭遇什么呢！？彩色忍者们能守护住姬乃吗！？